2005年及以后入学的学生按以下流程办理：
1．申办者到地级市一级报社对原毕业证书进行挂失；
2．申办者持挂失材料到教务处（综合楼201）填写《补办毕业证明书联系单》，至院长办公室（综合楼301）查取本人毕业证书编号；
3．申办者携带上述材料、申办者两张两寸照片，本人有效证件（委托他人代办者另请携带委托书和补办人身份证复印件）至教务处（综合楼201）办理毕业证明书。
2005年之前入学的学生按以下流程至苏州大学办理：
1．申办者到地级市一级报社对原毕业证书进行挂失；
2．申办者持挂失材料到苏州大学档案馆（苏州大学东校区敬文图书馆四楼）查取在校期间材料：①新生录检表、②学籍卡、③学生成绩单、④毕业证书领取签名册；
3．申办者携带上述材料、申办者两张两寸照片，本人有效证件（委托他人代办者另请携带委托书和补办人身份证复印件）至教务部综合办公室（凌云楼507）办理毕业证明书；
4．申办者到财务处缴纳补证费伍拾元（财务处只接受银行卡刷卡不接受现金）；
5．申办者将毕业证明书送至学校本部钟楼校长办公室一楼加盖校印、校长印及钢印。